医学动物防制

2019, v.35(07) 624-628

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广西防城港市HIV-1流行株env基因C2V3区序列特征及亚型分析
Sequence characteristics and subtype analysis of C2V3 region of env gene among HIV-1 strains in Fangchenggang City,Guangxi

劳飞翔;莫实德;邓培雪;黄洁洁;梁林盼;黎玲莉;廖玮;梁冰玉;叶力;

摘要(Abstract):

目的了解近期防城港市HIV-1流行毒株env基因C2V3区亚型及分布特征,为防城港市防治艾滋病工作提供科学依据。方法于2017年10月~2018年4月在防城港市人民医院收集199例定点随访的接受抗病毒治疗的HIV感染者或艾滋病病人(human immunodeficiency virus/acquired immunodeficiency syndrome,HIV/AIDS)的流行病学调查信息和10 ml外周血。从外周血白细胞中提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应对获得的HIV-1前病毒DNA env C2V3区基因片段进行扩增,并进行DNA测序,获得的DNA序列信息使用Sequencher 5.1、MEGA 5.0软件进行清理和分析。结果本研究共收集199例HIV/AIDS,其人口学特征主要以年龄18~49岁为主,占53.70%;职业以农民和待业为主,分别占42.59%、45.37%;学历以初中及以下为主,占89.81%;民族以汉族为主,占75.93%;传播途径以异性传播为主,占93.52%。成功扩增HIV-1env C2V3区基因108例,其中CRF01_AE(Circulating Recombinant Forms,CRF)亚型103例,CRF BC亚型3例,B、CRF59_01B亚型各1例。发现8种gp120 V3环顶端四肽,其中以GPGQ为主,占50.00%;其次为GPGR和GPGK,分别占22.22%、12.96%。预测辅助受体为CXCR4(chemo-kine receptor 4) 59例,占54.63%;其次是CCR5辅助受体(chemo-kine receptor 5)30例,占27.78%;CXCR4/CCR5辅助受体19例,占17.59%。结论防城港市主要流行HIV-1 CRF01_AE亚型,其流行毒株亚型存在多态性。防城港市HIV-1型CRF01_AE毒株膜区V3环氨基酸顶端四肽存在较高的多态性,使用CXCR4辅助受体的HIV-1毒株比例高于用CCR5辅助受体的毒株。

关键词(KeyWords): 人类免疫缺陷病毒1型;CRF01_AE亚型;V3环;预测辅助受体

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 广西自然科学基金(2018GXNSFAA138070);; 广西艾滋病防治研究重点实验室开放课题(gxlapt201403);; 广西医科大学未来学术之星—大学生课外创新科研课题(WLXSZX18085)

作者(Author): 劳飞翔;莫实德;邓培雪;黄洁洁;梁林盼;黎玲莉;廖玮;梁冰玉;叶力;

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